Zlecenia spedycyjne, przewozowe i pozostałe wprowadzane są do systemu CARGOS z podziałem na kierunki i spedytorów. Badany jest status klienta, stan rozrachunków i zleceń w toku, sposób rozliczeń. Spedytor zna na bieżąco  salda, przeterminowane faktury, kredyty kupieckie itd.

Zlecenia spedycyjne zawierają dane o ładunkach, o ich składowych, o dokumentach oraz o sposobie realizacji, który może być odmienny dla ładunków, a także podzielony dodatkowo dla każdego z nich. Ładunki te mogą być w dalszym ciągu uszczegółowione do pojedynczego elementu (colli) a następnie podlegać procesom magazynowania w tym kompletacji.

Wpisując zlecenia spedytor może wprowadzić  sugestie co do ich realizacji. Zlecenia przewozowe natomiast dotyczą nie tyle ładunków, co trasy podanej przez zleceniodawcę. Możliwe jest umieszczenie w nich także ładunków.

Zlecenia rozliczane mogą być według ofert, umów lub schematów naliczających automatycznie należności wg danych o zleceniu z zastosowaniem różnorodnych tabel cen i przeliczników. Pozycje mogą być także dodawane ręcznie, półautomatycznie wg cenników oraz pochodzić z zakupów (np. opłaty drogowe) lub z refaktur. Do zlecenia można wystawić wiele faktur, to pozwala na sukcesywne refakturowanie kosztów w miarę ich napływania. Dlatego w systemie pokazywany jest status zleceń, dzięki czemu łatwo jest zapobiec przeoczeniu jednej choćby pozycji.